Цифры разнятся. Когда я изучал этот вопрос, мне доводилось встречать и совсем фантастические версии - до 3-5 тысяч.
Лично я думаю, что истина где-то посередине. Вот почему:
1) По официальным данным в Останкино погибло 46 человек. Это просто смешно. Я неоднократно изучал хронологию событий посекундно и географию местности. По толпе, зажатой между двумя корпусами вели перекрестный огонь из пулеметов, потом с улицы дожали БТРы. Там даже теоретически не могло погибнуть 46 человек. Это был целенаправленный расстрел, стреляли по всему, что шевелиться. Выжить там могли только те, кто сразу залег в укрытие или успел отступить под защиту деревьев в парк.
2)4.10. Официальные цифры погибших при штурме ДС - это те люди, которых нашли тела и опознали. Существуют многочисленные свидетельства того, как трупы в огромном количестве увозили в черных мешках на грузовиках и баржах, московские крематории получили спецзаказ и работали без передышки. Сейчас сложно высчитать объективные цифры, ибо никто не считал, сколько всего было людей в ДС к началу штурма. Многие приехали из других городов, не предупредив никого - соответственно их там никто не искал. Но многие очевидцы свидетельствуют, что видели собственными глазами сотни трупов как в самом ДС, так и на стадионе и в окрестностях.

Еще один факт - госдума прекратила расследование событий в обмен на амнистию. Думаю, если бы расследование продолжилось, накопали бы много интересного, тем более по горячим следам.
Надеюсь, что когда-нибудь независимая комиссия назовет хотя бы приблизительную цифру погибших. В любом случае, не сомневаюсь, что она будет значительно превышать "официальные данные".