Войти в систему

Home
    - Создать дневник
    - Написать в дневник
       - Подробный режим

LJ.Rossia.org
    - Новости сайта
    - Общие настройки
    - Sitemap
    - Оплата
    - ljr-fif

Редактировать...
    - Настройки
    - Список друзей
    - Дневник
    - Картинки
    - Пароль
    - Вид дневника

Сообщества

Настроить S2

Помощь
    - Забыли пароль?
    - FAQ
    - Тех. поддержка



Пишет ivanov_petrov ([info]ivanov_petrov)
@ 2009-10-13 20:43:00


Previous Entry  Add to memories!  Tell a Friend!  Next Entry
ДНК: красивая картиночка
http://www.membrana.ru/lenta/?9748

"На этих изображениях близкие участки ДНК окрашены одним цветом. Хорошо видно, что в равновесной глобуле (вверху) части генома перепутаны в трёхмерном пространстве, а во фрактальной глобуле (внизу) с её иерархической структурой они и в объёме расположены близко друг к другу

В результате учёные сделали два основных вывода. Во-первых, человеческий геном "разбит" на два отсека: в первом хранятся активные гены, во втором более плотно изолированы "ненужные" части ДНК. Более того между двумя частями происходит постоянный обмен включающимися и выключающимися генами.
Второй вывод: геном представляет собой "фрактальную глобулу" (fractal globule). Эта структура позволяет:
упаковать ДНК невероятно компактно: плотность информации в ядре примерно в триллионы раз выше, чем в среднестатистическом компьютерном чипе;
избежать образования узлов или запутанных фрагментов, которые бы помешали нормальной работе ДНК;
быстро складываться и раскладываться геному во время активации и репрессии генов, репликации клетки.

Если немного проредить картинку, то разумность природного подхода проявляется ещё больше

Отметим, что ранее считалось, будто ДНК упакована в виде "равновесной глобулы" (equilibrium globule). Однако это конфигурация легко образует множество узлов. Фрактальная же глобула, которую теоретически предсказали около 20 лет назад, в живой природе никогда раньше не наблюдалась."
http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/326/5950/289
Comprehensive Mapping of Long-Range Interactions Reveals Folding Principles of the Human Genome

(Последнее замечание меня удивило - совершенно не в курсе. Кто знает - поясните. Это ошибка журналистов при пересказе?


(Читать комментарии) - (Добавить комментарий)


[info]qaraabayna@lj
2009-10-21 13:04 (ссылка)
Интуитивно ясно, что чем больше линейная молекула, тем дальше процесс ее самоорганизации в глобулу от Анфинсеновского самосворачивания

Каждая биомолекула возникает из небытия не одним махом. Белок постепенно растет во время трансляции, копия ДНК -в процессе репликации. Ясно, что при таком процессе идет параллельный процесс трехмерной организации в котором ближние контакты получают преимущество.

Если для небольшого глобулярного белка возможно в силу небольших барьеров достижение глобального минимума енергии, то для такой махины как суперспирализованная ДНК это уже невозможно.


Интересно рассматривалась ли смешанная модель: "клубок ниток", в котором статистка дальних ближних контактов зависит от координаты вдоль полимера.

(Ответить)


(Читать комментарии) -