: Расшифруют ваш геном за 4,5 K$
Так обещают специалисты американской компании Complete Genomics.
Стоимость секвенирования генома снижалась чрезвычайно быстро. Еще в 2003 году операция по расшифровке генома человека оценивалась в 300 млн долларов; через четыре года эта цифра уменьшилась до 1 миллиона, а еще через год — до 60 тысяч долларов. В 2008 году представители Complete Genomics заявили, что в ближайшем будущем предложат услугу по полной расшифровке человеческого генома, стоимость которой не превысит 5 тысяч долларов.
Используемая компанией методика секвенирования не слишком отличается от общепринятой: на первом этапе последовательность разделяется на сравнительно небольшие фрагменты однонитевой ДНК, на основе которых формируются кольца длиной приблизительно в 400 оснований. Затем эти кольца многократно копируются и превращаются в «шары ДНК» диаметром около 200 нм. Подготовленные образцы размещают на подложке для анализа, после чего компьютерная программа реконструирует на основании множества отдельных последовательностей ДНК полный геном.
Основное преимущество методики, по словам ее разработчиков, заключается в высокой плотности упаковки «шаров»: это позволяет снизить расход реагентов и ускорить процесс расшифровки. Секвенирование генома человека предполагается проводить за один день (!)
У предложенной технологии есть и недостатки. Эксперты отмечают ее невысокую точность: на каждые 100 тысяч просмотренных оснований приходится в среднем по одной ошибке. Поскольку геном человека включает в себя около 3 млрд букв генетического кода, в финальной версии расшифровки может содержаться до 30 тысяч ошибок.
Таким образом, технология явно сыровата для точного копирования генома - 30 тыс ошибок, слишком много для воссоздания работоспособного организма (а может и нет) Но для диагностическтих целей вполне годный метод. Один раз оцифровал свои гены, а дальше компьютер ищет а нем "баги", предросположенности к тому или иному заболеванию. Причем очень быстро.
Если будет большой спрос на оцифровку своей ДНК, процедура станет еще дешевле и, надеюсь, точнее.
Если на каждые 100 тысяч просмотренных оснований ДНК приходится в среднем по одной ошибке, то если провести процедуру повторно 2 раза, можно вычислить, где эти ошибки были. Потому что вероятность выпадения ошибки в том же самом месте стремится к нулю. Просто провести сравнение и вычленить сбойный нуклеотид!
Итого 13 500 $ за безупречный личный геном.
![[info]](http://lj.rossia.org/img/userinfo-lj.gif)
walter-simons@lj
Так обещают специалисты американской компании Complete Genomics.
Стоимость секвенирования генома снижалась чрезвычайно быстро. Еще в 2003 году операция по расшифровке генома человека оценивалась в 300 млн долларов; через четыре года эта цифра уменьшилась до 1 миллиона, а еще через год — до 60 тысяч долларов. В 2008 году представители Complete Genomics заявили, что в ближайшем будущем предложат услугу по полной расшифровке человеческого генома, стоимость которой не превысит 5 тысяч долларов.
Используемая компанией методика секвенирования не слишком отличается от общепринятой: на первом этапе последовательность разделяется на сравнительно небольшие фрагменты однонитевой ДНК, на основе которых формируются кольца длиной приблизительно в 400 оснований. Затем эти кольца многократно копируются и превращаются в «шары ДНК» диаметром около 200 нм. Подготовленные образцы размещают на подложке для анализа, после чего компьютерная программа реконструирует на основании множества отдельных последовательностей ДНК полный геном.
Основное преимущество методики, по словам ее разработчиков, заключается в высокой плотности упаковки «шаров»: это позволяет снизить расход реагентов и ускорить процесс расшифровки. Секвенирование генома человека предполагается проводить за один день (!)
У предложенной технологии есть и недостатки. Эксперты отмечают ее невысокую точность: на каждые 100 тысяч просмотренных оснований приходится в среднем по одной ошибке. Поскольку геном человека включает в себя около 3 млрд букв генетического кода, в финальной версии расшифровки может содержаться до 30 тысяч ошибок.
Таким образом, технология явно сыровата для точного копирования генома - 30 тыс ошибок, слишком много для воссоздания работоспособного организма (а может и нет) Но для диагностическтих целей вполне годный метод. Один раз оцифровал свои гены, а дальше компьютер ищет а нем "баги", предросположенности к тому или иному заболеванию. Причем очень быстро.
Если будет большой спрос на оцифровку своей ДНК, процедура станет еще дешевле и, надеюсь, точнее.
Если на каждые 100 тысяч просмотренных оснований ДНК приходится в среднем по одной ошибке, то если провести процедуру повторно 2 раза, можно вычислить, где эти ошибки были. Потому что вероятность выпадения ошибки в том же самом месте стремится к нулю. Просто провести сравнение и вычленить сбойный нуклеотид!
Итого 13 500 $ за безупречный личный геном.
walter-simons@lj