Эврика!
Кульман нашёл, как во flylinkdc++ выставлять приоритеты файлам!

Нет, милые мои хомячки, это не делается напрямую правым кликом по файлу в списке качающихся, как в качалках для ленивого быдла вроде utorrent.

Для этого нужно:

1. Ткнуть в меню "передачи".
2. Выбрать там пункт "очередь скачивания".
3. Найти в дереве очереди папку, куда собрался качать файл, которому хочешь поправить приоритет. Просто по имени файла - нельзя, будь добр вспомнить каталог.
4. Ткнуть на него правой кнопкой.
5. Найти раздел "приоритет" и, наконец-то, поменять приоритет. Причём приоритет нужно выбирать из таких развеселых вариантов, как, например, "высокий" и "самый высокий".

Круто, правда?