Да какая вообще разница как произносится. Английский язык на своей хвалёной латинице не произносится так, как пишется. И французский. И русский на кириллице не произносится так, как пишется. И нечего особо стремиться к точному произношению японского, всё равно не выйдет. Однако, удобнее иметь какую-то систему, нежели хаос. Вот есть отвратительная корейско-английская система. Но она однозначна, поэтому по уродскому написанию можно восстановить написание на хангыль, а это удобно. Вот и в японском так же.