я как-то взбесился и снес всё, в чьем названии было mime или xdg.
много чего поломалось, и пришлось восстановить-таки app-misc/mime-types,
но это, кажется, всё.
в итоге xdg-mime и xdg-open у меня нету, я поставил себе
программку linopen - у неё единственный конфиг файл, куда
ты всё сам пишешь руками, и сделал на неё alias xdg-open.
чему-то этого достаточно, чему-то нет, но страданий никаких
больше моральных не вызывает.