Sat, Sep. 4th, 2010, 09:52 pm

Решил завести себе аккаунт за пределами ЖЖ. Это не переезд - а именно что новый аккаунт. Тут не будет записей, характерных именно для блога - скорее это место для моих относительно серьезных текстов, статей и прочего.


4 сентября 2005 года

Fri, Jan. 20th, 2006, 12:37 am
снимки

Картинка 800x600, 38,25 КБ - я в микроскопной )
В темноте выглядит все очень красиво. Темно потому как срезы флуоресцентные и краситель выцветает на свету. Не мгновенно, это не фотопленка - но тем не менее хранить их надо в темноте. Средний срок жизни стекла - две-три недели, потом на нем вместо красивой картинки можно увидеть невнятное фоновое свечение.
картинка 500x352, 10,39 КБ )
Особенно красиво "светится" (ну, думаю что всем понятно - рассеивает падающий на него свет. А испускаемый красителем свет как раз и не виден, его полностью забивает проходящий от лампы) стекло на предметном столике:
Картинка 500x439, 10,57 КБ )
Сверху на микроскопе можно переключать светофильтры - и вместо синего света сделать зеленый. Если на стекло со срезами светить синим - то один краситель поглощает синий и испускает зеленый свет. Получается вот такая вот картинка:
Картинка 465x582, 35,61 КБ )
Можно переключить цвет излучения на зеленый - тогда другой флуоресцентный краситель (метка на другой белок) будет поглощать кванты зеленого света и давать красное свечение:
Картинка 500x439, 10,57 КБ )
Картинка 384x423, 10,46 КБ )

Sat, Dec. 31st, 2005, 12:47 am

Сидел дома, собирал трехмерные модели. Значительно ускорен процесс предварительной обработки изображений, получилось же...

Вся мощь трехмерной реконструкции состоит в том, что вы можете видеть:

трехмерный объект с разных сторон и срезы с оного в произвольном направлении - 46,73 КБ )

- берете мозг и режете его не фронтальными ломтиками, а как-нибудь наискосок или в горизонтальной плоскости.

...трехмерный объект и несколько срезов - 101,58 КБ )

Линии показывают яркость изображения - для наглядности (и эстетического эффекта) я перевел градации серого в псевдоцвета. Некоторая неровность поверхности мозга - артефакт, на самом деле - он гладкий

Посмотреть поближе - 252,45 КБ )

Вы можете вообще делать все, что угодно:

смотреть поверхности, объем в целом, срезы... - 252,09 КБ )

Thu, Dec. 15th, 2005, 03:50 pm
кластеры в неокортексе?

Ни черта не понимаю: кто-нибудь из коллег это прокомментировать может?

Меня глючит - или они действительно пишут про то, что нашли кластеры в коре, причем такие, которые по всей коре? Под катом - пара абзацев с моими вопросами.

Read more... )

Wed, Dec. 14th, 2005, 04:07 am

Конфокальная микроскопия в действии!

Картинка 800x600, 86,13 КБ )

Thu, Nov. 24th, 2005, 10:00 pm

Начали обучение новой серии животных. Разумеется все подробности - по завершению работы.

Tue, Nov. 8th, 2005, 10:11 pm
3D гиппокамп, паттерн экспрессии

Собирал весь день трехмерную модель мышиного гиппокампа. Дома - у меня тут комп более шустрый и его никто особо не занимает. Собрал - результат виден под катом (точки - это клетки, которые синтезировали кое-какой белок).
Read more... )

Tue, Sep. 20th, 2005, 09:53 pm
geek code

a22 s++:-- y e+ r+ C++++ N++ W L P(VB)+ HW:+ H GF(R)+ g+ MD OC t-- b++:+

Mon, Jul. 18th, 2005, 10:15 pm
ИГХ - крупный план, 488-нм краситель.


Посмотреть в полный размер, 225 килобайт, 910x728 )

Научная картинка дня - участок мышиного мозга под флуоресцентным микроскопом, снимок автора. Яркие точки - клетки, в которых идет синтез определенного белка.

Для выявления мест синтеза используется весьма сложный и тонкий метод - основанный на свойстве антител (молекулы, играющую важнейшую роль в формировании иммунитета) специфически связываться с тем или иным попавшим в организм веществом (антигеном).

Сначала срез мозга помещается в раствор с антителами к интересующему нас белку - и за одну ночь происходит связывание антител. Далее делается нетривиальный ход: поскольку первые антитела были выработаны в организме кролика, то они по определению чужеродны для организма другого животного - например осла. И антитела осла к антителам кролика садятся на первые метки (кроличьи) вторым слоем, по нескольку штук на одну молекулу кроличьего антитела к молекуле белка мыши.

Результат - усиление сигнала. Одна молекула белка - два первичных антетела и четыре вторичных, причем в реальности получается все же больше. Вторичные антитела помечены флуоресцентным зондом - и мы получаем красивую зеленую флуоресценцию там, где нервные клетки синтезировали белок.

Пора, кстати, прояснить что за белок и зачем вообще его смотрят. Белок этот относится к группе так называемых "немедленных ранних генов" - "генов" потому как каждый ген кодирует тот или иной белок, соответственно для синтеза белка необходимо тот или иной ген задействовать.

А задействование тех или иных генов происходит в ответ на какое-либо определенное воздействие. В нашем случае мы имеем дело с белками, которые начинатют синтезироваться при обучении животного. По сути мы видим клетки, которые каким-то образом вовлечены в этот процесс... перед вами картина обучения на молекулярно-биологическом уровне.