Одна неприятность - нет хороших способов измерять сложность.

А что ее измерять, появились новые элементы - значит усложнение (развитие), исчезли элементы - упрощение.

произошло вторичное упрощение для усиления функции или имеет место именно деградация как ослабление - понять нелегко.

Весь вопрос, как объект выделять, имхо понятно, что при структурном подходе отдельный организм не может рассматриваться как объект. В структуру должна как-то входить еще и среда (например).

Т.е. постановка вопроса о развитии организма (самого по себе) бессмыслена (если мы понимаем развитие, как усложнение структуры)