А ещё в новых версиях GIT появилась отличная команда git stash. Это когда у вас есть локальные модификации, которые коммитить ещё рано (или совсем не нужно), а нужен чистый репозиторий. Так вот, обычно я откладывал в сторону эти модификации так:

git diff > my.diff
git diff | patch -p1 -R

А теперь это можно делать так:

git stash

Ну и там есть команды, чтобы посмотреть отложенное в сторону, применить его, и т.д.

Update: ну да, не "в новыз версиях", а несколько раньше. Эта фича появилась в середине 2007 года. Чёрт его знает, почему я про это сейчас пишу. Наверное, потому, что с недавних пор git в некоторых случаях предлагает явно ей воспользоваться.