Сериал Хранилище 13 имеет параллели с другими фильмами :

- Хранилище № 13 имеет прямую аналогию с правительственным складом, показанным в конце фильма «Индиана Джонс: В поисках утраченного ковчега» и в начале фильма «Индиана Джонс и Королевство хрустального черепа» — на этом складе спрятаны ковчег завета и хрустальный череп.

- Идея обычных предметов с необычными свойствами была также использована в сериале «Потерянная комната».

- Также как в сериале «Пятница, 13-е» использована тема коллекционера, пытающегося собрать и нейтрализовать роковые предметы.

- Сериал сильно связан с сериалом «Эврика». В пятой серии второго сезона, в хранилище приезжает Даглас Фарго, для того, чтобы обновить им в компьютерах систему. В пятой серии четвертого сезона сериала «Эврика», Клаудия Донован приезжает в Эврику, для того, чтобы забрать новое Желе. А Фарго интересуется: «Как там компьютеры после обновления?». А в шестой серии третьего сезона опять появляется Даглас Фарго (он является разработчиком компьютерной игры, в которой застревает и он сам, и агенты хранилища).На заметку: в «Хранилище 13» несколько эпизодических ролей сыграли актёры, исполняющие главные роли в «Эврике». Джо Мортон (10 эпизод первого сезона «Хранилища 13») играет Генри Дикона в «Эврике». Ниалл Маттер (Зейн Донован) и Эрика Сирра (Джозефина Лупо) в 9 эпизоде первого сезона играют роль влюбленной пары аферистов, а в «Эврике» у их персонажей любовные отношения.

- В сериале Люди Альфа, в начале 5 серии главные герои разговаривают с женщиной, которая представляется как «Я доктор Калдер из ЦКЗ», она держит в руках фиолетовые перчатки и роль этой женщины исполняет Линдсэй Вагнер. (вот это я проморгала!)

- В 10 серии 2 сезона в машине времени используется поточный конденсатор из фильма Назад в будущее

- В 11 серии 2 сезона Уэллс одевается в Лару Крофт

- В трилогии Библиотекарь: В поисках копья судьбы развивается похожая тематика.