То, что топ яндекса имеет возможность ручной модерации, ни для кого не секрет. Странно было бы ожидать обратного.
Но в данном случае, возможно, пост из топа вылетел автоматически - на него не так много ссылок находится.

там посты с меньшими показателями есть.... и с такими же - каментов вроде тоже там меньше...

Яндекс, насколь я понимаю, еще положение в рейтинге как-то учитывает ("авторитетность") - возможно, не только автора поста, но и комментаторов и ссылающихся.
Хотя все равно от накруток помогает слабо;)