Вот тут пригорело. freedesktop есть везде уже, кроме, может, разве что слаки. Пользуетесь .desktop файлами, dbus, cairo, fontconfig, mesa - это всё freedesktop.
systemd придет в убунте в следующем релизе, никуда не денетесь.
dependency hell - такой же атрибут дебиана и убунты, только чтоб собрать пакет надо писать 20 boilerplate файлов вместо одного. Нас всех спасет ostree или что-то подобное.

Я даже не буду упоминать что centos - это федора-2 релиза.