Мы же не собираемся все мягкие согласные обозначать через йот. Априори, предполагается, что с гласными переднего ряда согласные будут мягкими, а не твердыми, как например в немецком или английском. (Ш и аффрикаты исключение)Мало кто над этим задумывается, но человеку, владеющему русским, это интуитивно понятно, он будет и латиницу даже без специальных обозначений мягких согласных читать согласно привычному произношению. Сейчас это не принципиально. А прописать это в правилах произношения и транскрипции проще, чем заморачиваться с перечеркнутым л.