ну, не 0 точек, а штук 20. но все равно - 20 несвязанных картинок, с большим перекрытием.

что-то у меня предубеждение перед мелкософтовскими продуктами.

Что-то странно: он у меня бывает "терял нить" на многорядных панорамах, и плохо сопоставлял картинки между рядами, но на соседних картинках точки искал чётко.
Попробовать всё-таки "частями" (может, ему правда крышу рвёт от 200 кадриков), попробовать другую точкоискалку (autopano-sift-c например, она, если я правильно помню, скачивается отдельно). Можно ещё в опциях cpfind покопаться, хотя они по дефолту должны быть разумными...