Мне сложно целиком судить об этом вопросе - есть рычаги формальные и неформальные. Но тот же Садовничий успешно блокирует все попытки ввести в МГУ ЕГЭ, опираясь на Ассоциацию выпусников МГУ (где самый широкий спектр личностей).

Просто в данном случае сразу мобилизуется наиболее активная и сильная часть ректоров, которая устраивает PR-кампанию с открытыми письмами на имя Президента от всех профессоров своих вузов и пр., раздает интервью, проводит работу в Госдуме с депутатами, устраивает различные мероприятия.

То есть:
1. Введение назначаемости ректоров с большой долей вероятности не удастся провести без шума.
2. Ресурсов Фурсенко и идеологов ВШЭ в ситуации открытой борьбы явно не хватит для полной реализации своих прожектов. Путина они в открытую, что ли, подключать будут к такому делу?