Сегодня исполняется 10 лет со дня официального окончания гражданской войны в Таджикистане, унесшей десятки тысяч жизней, превративших многих жителей, прежде всего русских, в беженцев. И хотя фактически она закончилась еще в 94-м, окончательный договор о мире между правительством и оппозицией был подписан лишь 27 июня 1997-го. Отголоски этой войны до сих пор ощущаются не только в Таджикистане, но и в России.

Начало современного этапа в истории Таджикистана связано с процессом распада СССР, нарушением баланса сил, сложившегося в республике в советское время. Первыми признаками кризиса власти стали прошедшие в Душанбе в феврале 1990 выступления светских национал-демократов из движения «Растохез» (Возрождение). Несмотря на заверения организаторов выступлений, они послужили сигналом к началу исхода из столицы и страны русского и русскоязычного населения.

24 августа 1991, после провала путча в Москве, Верховный совет республики принимает декларацию о государственном суверенитете. В ноябре происходят выборы президента на альтернативной основе. Демократические силы («Растохез», отколовшаяся от него Демократическая партия и Исламская партия возрождения, находившаяся до октября под запретом) выдвинули кандидатом известного кинорежиссера Д.Худоназарова. Он однако проиграл выборы занимавшему пост президента бывшему руководителю Компартии Р.Набиеву.

Обретение страной независимости в конце 1991 обострило вопрос о власти. Шаткое равновесие сил было нарушено весной 1992. Противостояние правительства и набравшей к тому времени силы оппозиции вылилось в противостояние между ними на площадях и улицах Душанбе. В мае было сформировано правительство национального примирения, в котором оппозиция получила треть мест. Несмотря на это между силами правительства и оппозиции начались вооруженные столкновения, резко ухудшилась экономическая ситуация и увеличилась миграция.

В начале сентября президент Набиев был вынужден подать в отставку. Осенью в разных частях страны происходили стычки и столкновения нередко с применением тяжелого оружия. В Душанбе наступил уголовный беспредел. Потери с обеих сторон к октябрю составили 15-20 тыс. убитыми и несколько десятков тысяч ранеными.

Видное место в противостоянии заняли клановый и этнорегиональный факторы. Правительственную сторону возглавили представители номенклатурно-хозяйственных кланов из южной Кулябской и северной Ленинабадской областей. В последней сильны были настроения в пользу отделения от юга, однако кулябцам удалось к концу 1992 справиться с сепаратистскими угрозами. Базу поддержки правительственных сил, сформировавших и вооруживших отряды Народного фронта, составили оставшиеся без работы и средств к существованию молодые люди, в значительной части узбеки. Заметную роль среди оппозиции играли памирцы, особенно жители Душанбе, а также выходцы из Каратегина (Гармского района) и Дарваза (Тавильдаринской долины). Силы оппозиции в условиях вооруженной борьбы возглавили исламисты, и борьба приобрела оттенок политико-идеологического противостояния с косвенным включением в нее соседних государств.

В декабре 1992 отряды НФ вошли в Душанбе и учинили расправу над памирцами и каратегинцами. Критическая ситуация в городе сохранялась до февраля 1993. Одновременно и вплоть до лета ожесточенные бои велись в Гарме и Тавильдаре, в Курган-тюбе и в Гиссарской долине на приграничных с Узбекистаном территориях. Особой ожесточенности они достигали в местах действия формирований,возглавленных полевыми командирами. В марте был убит наиболее одиозный среди них — С.Сафаров.

В декабре 1992 председателем Верховного совета избрали выходца из Куляба Э.Рахмонова. В наведении порядка участие принимали Коллективные миротворческие силы, созданные государствами - участниками Договора о коллективной безопасности. Наибольшие расходы по содержанию КМС несла Россия. В республике продолжали находиться 201-я мотострелковая дивизия и пограничные войска РФ. В боевых действиях нередко принимала участие авиация из Узбекистана.

Пик гражданской войны был пройден в конце 1992 — начале 1993, затем она продолжались с меньшей и угасающей степенью интенсивности. Но ее по-прежнему отличала крайняя порой жестокость на фоне вышедшей из строя системы нормального снабжения городов и сел продовольствием и другими средствами поддержания жизни. Происходили грабежи и мародерство, этнические чистки, насилия, убийства политических и общественных деятелей.

Оттесненные из центральных районов силы исламской оппозиции перешли границу с Афганистаном и создали там сеть лагерей беженцев. В 1993 собравшиеся в Тегеране оппозиционные лидеры объявили о создании ОТО (Объединенной таджикской оппозиции). В апреле 1994 в Москве прошел первый раунд переговоров между представителями РТ и ОТО (при участии ООН и заинтересованных соседних государств),где было достигнуто соглашение о временном перемирии.

Летом Верховный совет принял решение об одновременном проведении в ноябре референдума по новой конституции и выборов президента. Значительным большинством голосов избрали Э.Рахмонова (его соперником выступал лидер ленинабадских кругов, бывший премьер-министр А. Абдуллоджанов).

В 1994-1997 состоялись еще семь раундов переговоров между правительством и оппозицией. 27 июня 1997 в Москве президент Рахмонов и лидер ОТО С.А.Нури подписали Общее соглашение об установлении мира и национального согласия, официально положившее конец 5-летней гражданской войне. Соглашение предусматривало всеобщую амнистию, обмен пленными, создание условий для возвращения беженцев, демобилизацию воинских формирований оппозиции с предоставлением им возможности влиться в ряды вооруженных сил республики. Предусматривалось, что представителям оппозиции выделяется 30% должностей в центральном аппарате и они включаются в местные органы власти. Для наблюдения над ходом выполнения Общего соглашения создавалась Комиссия по национальному примирению (КНП) на паритетных началах.