Войти в систему

Home
    - Создать дневник
    - Написать в дневник
       - Подробный режим

LJ.Rossia.org
    - Новости сайта
    - Общие настройки
    - Sitemap
    - Оплата
    - ljr-fif

Редактировать...
    - Настройки
    - Список друзей
    - Дневник
    - Картинки
    - Пароль
    - Вид дневника

Сообщества

Настроить S2

Помощь
    - Забыли пароль?
    - FAQ
    - Тех. поддержка



Пишет ivanov_petrov ([info]ivanov_petrov)
@ 2009-06-17 07:38:00


Previous Entry  Add to memories!  Tell a Friend!  Next Entry
атлас бактерий, проживающих на человеческом теле, и рассказ про сиди
по ссылке http://avvas.livejournal.com/3590931.html
http://www.kommersant.ru/doc.aspx?DocsID=1181842
Всего удалось обнаружить 205 видов, представляющих 19 родов.
"Если эту "перепись населения" представить в процентах, получается такая картина: 51,8 процента — вид Actinobacteria, используемый в лабораторных условиях для получения антибиотиков, 24 — вид Firmicutes, к которому относятся и полезные молочнокислые бактерии, и патогенные клостридии, и даже возбудитель столбняка, еще 16,5 — вид Proteobacteria, настоящие "нарушители спокойствия", ответственные за такие болезни, как, например, язва желудка, менингит или гонорея, наконец, 6,3 процента — Bacteroidetes — симбионты кожи и кишечника, которые также часто становятся причиной различных заболеваний при резком снижении иммунитета.
Причем самым представительным участком оказалась, как ни странно, не подмышка и даже не пах, а сухая ладонная сторона предплечья — здесь ученые обнаружили аж 44 вида бактерий. Зато меньше всего микроорганизмов за ушами — здесь обитает всего 15 видов. Причем на плотность расселения микроорганизмов не влияют даже такие факторы, как возраст, пол, род деятельности и рацион.
В полости рта взрослого человека обитает до 200 различных бактерий и они создают неоднородную среду. Зато уже в пищеводе бактерий на порядок меньше — считается, что сюда попадают лишь "транзитные" микробы изо рта и носоглотки. И уж совсем небогата микрофлора желудка — из-за высокой кислотности здесь выживают только кислоустойчивые хеликобактеры, стрептококки, лактобациллы да стафилококки. Соотношение тех или иных бактерий в микрофлоре желудка зависит от потребляемой пищи.
Кровь, сердце, печень, почки считаются стерильными. Если бактерии проникают в кровь — начинается сепсис. Однако мы не все можем обнаружить, может, там что-то и есть. Но если организм здоров, он быстро уничтожает "перебежчиков", оказавшихся в крови. "


Шикарный рассказ про сиди
http://zharkovsky.livejournal.com/240236.html?thread=2387564#t2387564
за ссылку и вопросы спасибо flaass

[info]flaass@lj
У меня впечатление, что оптические диски именно так и появились. С самого начала и до сих пор - никаких внешних изменений. Не то что магнитофоны или магнитные диски.

[info]city_rat@lj
Вы, наверное, не очень хорошо их историю знаете :)

Например, существовали лазерные видеодиски размером с виниловую долгоиграющую пластинку. Я уж молчу про разновидности оптических дисков, которые обкатывали для компов.

И это только то, что касается размеров. Разница в потрохах и принципах на всех уровнях превосходит скромные изменения между катушками и кассетами на порядки. В конце концов пленка в кассете крайне мало отличается от катушечной.

[info]flaass@lj
Не очень хорошо - это мягко сказано :)
Но магнитофоны во всех своих размерных классах выходили на широкий рынок. А оптические диски, значит, долго варились в какой-то нише, пока не доварились до нынешнего внешнего вида, и лишь тогда хлынули?

[info]city_rat@lj
Вы забыли, что в СССР мы имели достаточно слабое представление о широком рынке :)

Впрочем, если помните начала кооперативного расцвета - там на кассетах очень любили писать "первая лазерная копия!". Это как раз оно. Иногда это была чистая правда - честные барыги предпочитали писать как раз с лазердисков.

И нельзя назвать это такой уж узкой нишей - рынок тогда в принципе был иной, электроника еще не дошла до уровня такого ширпотреба, как сейчас. Да, лазерный видеопроигрыватель - это было хай-энд устройство, не в каждом сортире стояло. Точно так же относительно редкими были и некоторые форм-факторы магнитофонов - много вы видели DAT или там популярных одно время среди американских аудиофилов восьмидорожечников? Между тем в своей категории - вполне обычные вещи. Такую же специфическую нишу довольно долгое время занимали и аудио-CD. Потом да - процессоры стали стоить дешевле грязи и хлынуло сразу все.

При этом CD, хоть и другого размера, но прямой наследник лазердиска. А DVD, и тем более БлюРей какой-нибудь общего с CD имеют только размер, ну и самый-самый общий принцип "читаем лазером", в остальном - разница как между стереопластинкой и восковым валиком для фонографа. А магнитооптику взять? Это уж совсем ветка вбок - но тоже ведь оптический диск, и более чем распространенный. Причем у магнитооптики как раз полный зоопарк размеров, и многие были вполне востребованы и доступны на рынке. Минидискплеер вон он у меня в шкафу валяется.

"Сони", кстати, пыталась сделать свой форм-фактор (UMD) и для обычной оптики, это у них в традиции, но миллионы уже проданных полок, стоек, боксиков и кейсиков под старый размер - существенный рыночный довод, даже предложенный было паллиатив в виде коробки-книжки для DVD не слишком-то востребован оказался. Но, конечно, более существенно - совместимость приводов просто на уровне размера дырки. Так что сейчас большинство разработчиков форматов не парятся и придерживаются стандарта 120 мм. Разум возобладал, в отличие от, скажем, карт памяти, но там своя история, не буду в сторону уходить. А вот сам читающий блок в мультипроигрывателях - комбайн, разница у форматов даже в цвете лазера.

Впрочем - мини-CD вы не видали никогда? У них то же большое достоинство - можно запихнуть в тот же привод, что и стандартный CD, да это и есть CD, только меньшего размера. Посмотрите на любой дисковод с треем (не ноутбучный) - там по центру небольшое углубление оно как раз для "мини".

В общем, идея "а давайте будем делать все диски диаметром 12 сантиметров" - не то, с чем бы я поехал в прошлое, ей-богу :)

[info]flaass@lj
А вот с идеей "читаем лазером" вполне можно бы. При такой плотности информации (даже на первых аудио) априори кажется невозможным надежно ее считывать маленьким дешевым механическом устройством, да еще и с пластмассовыми элементами, да еще и трясет его, да и лазеры там дешевенькие. До сих пор не верю, что это все работает :)

[info]city_rat@lj
Ну, во-первых, как вы помните, к началу выпуска аудиплееров технология была уже отработана на ряде аналогов, развитие вполне традиционное: точно так же от восьмидюймовых шли к пятидюймовым, потом к трехдюймовым магнитным дискетам. Во-вторых, плотность записи на аудио не так уж велика, а точная механика была отработана на тех же дискетах, например. Восьмидюймовки, на минуточку, это начало семидесятых, а ширина дорожки там обусловлена не проблемами с точнойтью позиционирования, а самой техникой записи. Лазерные пластинки и появились в рамках попытки уйти от громозких считывающих головок. В-третьих, в оптической технологии был применен старый добрый инженерный способ - "не можешь обеспечить механическую точность - введи управляющую обратную связь". Лазер подгоняется в нужное место путем последовательных приближений. В тех же жестких дисках механическая точность требуется существенно более высокая. Не слыхали про айбиэмовские винты размером с карточку памяти? Они, правда, быстро вышли в тираж из-за удешевления кристаллической памяти, но это был шедевр точной механики, и это - конец прошлого века. В-четвертых - первые ридеры были не такими уж маленькими и дешевыми, а скорость чтения у них была в несколько _десятков_ раз меньше, чем у современных. Да и пластмасса вытесняла узлы очень постепенно - по мере отработки технологии определяли, где можно. Кстати, опять-таки упростить механику позволило удешевление вычислительных мощностей - там где раньше была прецизионка и сложная полуаналоговая обратная связь - сейчас просто подавление шумов и очень быстрые итерации цифровыми методами. В-пятых - мелкая механика за последние лет двадцать действительно шагнула далеко вперед. Копеечной цены прецизионные микромоторы меня самого в экстаз приводят. Но поверьте инженеру - все это в рамках мэйнстрима развития технологий. Скорость развития впечатляет, но не видно ни одного "взятого с потолка" инженерного решения, внезапного скачка. Все - шажочками. Справшивается - а зачем, если знаешь готовое решение? Т.е. придумать путешественника из будущего, который предложит инженерам "Сони" делать болванки диаметром 120 мм. можно, но вот все остальное им явно пришлось делать самим.

Впрочем, мое потенциальное участие в космической программе примерно так же бы выглядело. Я не могу притащить им готовую технологию, могу только передать информацию об ошибках. Т.е. вмешательство было бы заметно только по существенному снижению "тупиков". Но в компьютерном мире мы как раз такого и не наблюдаем - разработчики почти всех современных стандартов имеют дикое количество мертвых форматов на своем счету, а многие их тех, что пошли в серию, как раз хуже тех, что не пошли. Чисто рыночный хаос, увы.


(Добавить комментарий)

Простите, вспомнил старинный анекдот
[info]nickel1@lj
2009-06-17 01:40 (ссылка)
- При поцелуе передаётся три миллиона микробов!
- Но с другой стороны, от стольких же и избавляешься!

(Ответить) (Ветвь дискуссии)

Re: Простите, вспомнил старинный анекдот
[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 01:48 (ссылка)
Кому поцелуй, а кому эмиграция.

(Ответить) (Уровень выше)


[info]sirin@lj
2009-06-17 02:31 (ссылка)
так вот она какая - ягодичная складка!

(Ответить) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 03:01 (ссылка)
всем известно, что у красивого человека ягодичная складка доходит до шейной области. Слышали выражение "ноги от шеи растут"? Ну, об этом.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]sirin@lj
2009-06-17 03:07 (ссылка)
слышать-то я слышал, а вот видеть не доводилось.
разве что, у некоторых головоногих.
хотя какая там у них шея.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 03:17 (ссылка)
Я Вам больше скажу. У очень многих то. что называют деликатно "извилинами" - просто ягодичные складки. И ничего - эволюция терпит и нам велит.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]sirin@lj
2009-06-17 03:43 (ссылка)
у нас говаривали: одна извилина, и та - ниже спины.
а вот классик утверждал, что иные дамы прекрасны без извилин, да-с...

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 03:53 (ссылка)
классик явный извращенец. у них, у классиков, часто так - природа, понимаешь, отдыхает на каких-то их способностях. а мы, читатели - страдаем

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]sirin@lj
2009-06-17 04:25 (ссылка)
скорее, он был эстетом. ему было противно представлять сморщенный студенистый мозг в прелестной головке любимой.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 04:35 (ссылка)
пусть бы представил моногранный кристалл

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]sirin@lj
2009-06-17 04:36 (ссылка)
чистого разума! да-да!

(Ответить) (Уровень выше)


[info]kouprianov@lj
2009-06-17 02:48 (ссылка)
Хорошо бы сделали сетевую версию. Был бы роскошный образовательный ресурс.

(Ответить) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 03:02 (ссылка)
про бактерий. в смысле? Атлас тела нормального вида - с картинками расцветших в чашках Петри колоний, привязанных к складочкам и влуминам органона нашего? Да, надо бы.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]kouprianov@lj
2009-06-17 03:42 (ссылка)
угу. только я бы не останавливался на чашках Петри. сюда же -- электронку, сюда же -- ссылки на геномы, сюда же -- популярные статьи про самих бактерий и болезни (если они их могут вызвать).

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 03:52 (ссылка)
вот дали - http://www.g-language.org/g3/

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]kouprianov@lj
2009-06-17 05:34 (ссылка)
Ну, это только половина дела, хотя и "бóльшая". Осталось SEM и TEM изображения, фото колоний, где есть, человекочитаемые описания. Ну и привязка к телу.

(Ответить) (Уровень выше)


[info]dok_zlo@lj
2009-06-17 03:06 (ссылка)
ну, "впервые" это они так, для красного словца.


У. К. Нобл. Микробиология кожи человека
Microbiology of human skin

Издательство: Медицина, 1986 г.
Твердый переплет, 496 стр.
Тираж: 8000 экз. - http://www.ozon.ru/context/detail/id/2513909/

(Ответить) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 03:18 (ссылка)
спасибо. не читал, конечно.
вот ежели б она еще и в сети была... Тады ой.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]dok_zlo@lj
2009-06-17 08:44 (ссылка)
ну, указанный дядечка темой занимался основательно и давно. я читал в бумаге, но по идее должна была бы быть на английском. + куча публикаций, в свое время тема модная была. сравнивали например осемененность (термин уж какой есть) у здоровых людей и у людей бронхиальной астмой, или бронхитом....ну и так дальше

(Ответить) (Уровень выше)


[info]eg0_ist@lj
2009-06-17 03:10 (ссылка)
Буэ... И зачем людЯм аппетит портить?

(Ответить) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 03:19 (ссылка)
Простите, не заметил, что вы кушаете. Впредь буду острожнее.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]eg0_ist@lj
2009-06-17 03:23 (ссылка)
Вы уж постарайтесь, ага?

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 03:25 (ссылка)
непременно

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]eg0_ist@lj
2009-06-17 03:32 (ссылка)
Я в Вас верю!

(Ответить) (Уровень выше)


[info]deadkittten@lj
2009-06-17 03:38 (ссылка)
Ага, а это для любителей на геном тех же бактерий полюбоваться -- http://www.g-language.org/g3/ :)

(Ответить) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 03:51 (ссылка)
ух ты. ишь ты.

(Ответить) (Уровень выше)


(Анонимно)
2009-06-17 04:45 (ссылка)
Вот откуда ноги растут: http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/324/5931/1190
Меня поражает умение всех этих репортеров тщательно скрывать оригинальную информацию
===
С уважением,
А. Шипунов

(Ответить) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 04:47 (ссылка)
спасибо! я чуть-чуть поискал первоисточник - не нашел. А вот он. правда, все равно недоступен, но хоть заголовок и авторы

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)

Ваще говоря,
[info]sgustchalost@lj
2009-06-17 10:27 (ссылка)
мы имеем тупой, ошибочный перевод с чего-то.

Вид Proteobacteria. Гы.
Чьи клеточные стенки состоят из липополисахарида. Гы-гы.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)

Re: Ваще говоря,
[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 15:57 (ссылка)
я уже устал обращать внимание на то, что в прессе именуют видом. Для себя читаю "таксон", ранг может быть любой. Ну и т.п.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)

Re: Ваще говоря,
[info]qaraabayna@lj
2009-06-18 13:29 (ссылка)
Размытая штука, в которой размыты границы начала размытости границ начала рамытости...

(Ответить) (Уровень выше)


(Анонимно)
2009-06-17 11:34 (ссылка)
Если надо, могу прислать.
===
А. Шипунов

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 16:10 (ссылка)
Спасибо, не с руки. я сейчас занят все же не этим. не возьмусь читать...
есть есть возможность получить файлы - мне бы Пагеля. Вдруг случайно есть каким-то образом
Paracelsus: an introduction to philosophical medicine in the era of the Renaissance
Walter Pagel
William Harvey's biological ideas: selected aspects and historical background
Walter Pagel
New light on William Harvey
Walter Pagel
Joan Baptista Van Helmont: Reformer of Science and Medicine
Walter Pagel
The smiling spleen: Paracelsianism in storm and stress
Walter Pagel
Religion and neoplatonism in Renaissance medicine Collected studies series The vindication of "Rubbish" Religious motives in the medical biology of the XVIIth century The religious and philosophical aspects of van Helmont's Science and medicine Paracelsus' ätherähnliche Substanzen und ihre ...
Walter Pagel, Marianne Winder

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


(Анонимно)
2009-06-17 18:59 (ссылка)
Написал Вам на мейл

(Ответить) (Уровень выше)


[info]muh2@lj
2009-06-17 05:31 (ссылка)
/При этом CD, хоть и другого размера, но прямой наследник лазердиска. А DVD, и тем более БлюРей какой-нибудь общего с CD имеют только размер/

Лазерный видеосиск - аналоговый, за что и ныне любим эстетами. В этом смысле ЦД и ДВД - оба цифровые - заметно ближе друг к другу, чем в видеодиску.

(Ответить) (Ветвь дискуссии)


[info]city_rat@lj
2009-07-10 19:24 (ссылка)
Это неверно. LD - цифровой примерно в той же степени, что и CD, хотя привязка к "аналоговому" сигналу у первого немного выше в силу сложности видеосигнала, который тогда не умели как следует разломать на пиксели. Что уж там любят эстеты - неизвестно, аналоговая картинка всех форматов, доступных во времена расцвета LD была заведомо хуже, чем у лазердиска. Количество строк - это вам не аудио с абстрактными цифровыми артефактами. Формально же и то и то - это дискретная запись, последовательность "нулей и единиц", никакого аналога там нет и в помине.

А что касается общности - CD, как и LD, не имел коррекции ощибок, это, в сущности, все тот же аналоговый сигнал, записанный цифрой. Поэтому "пиратские" CD бывали реально хуже, чем "лицензия", и по мере использования CD так же "заигрывался", как и виниловая пластинка, только в меньшей степени.

А DVD - это уже чисто "компьютерный" формат, там файловая система, там CRC и т.д.

(Ответить) (Уровень выше)


[info]shao_s@lj
2009-06-17 10:45 (ссылка)
"24 — вид Firmicutes, к которому относятся и полезные молочнокислые бактерии, и патогенные клостридии, и даже возбудитель столбняка" - это всё точно один ВИД бактерий, а не род?

(Ответить) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-17 16:00 (ссылка)
ё-моище. Какой к черту вид, род... Это дико безграмотный перевод, к современной таксономии бактерий и ее рангам прямого отношения не имеющий. Тут в комментах дали ссылку на первоисточник. А что журналюги понятия не имеют. что такое вид - и таксон вообще - я уже устал обращать внимание. Это выше культуры журналиста, понимать такое

(Ответить) (Уровень выше)


[info]qaraabayna@lj
2009-06-18 13:27 (ссылка)
90% клеток, которые перемещаются всюду со мной - бактериальные. Это - первое, что меня впечатлило в метагеномике.

(Ответить) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-18 13:37 (ссылка)
Как я понял, если упростить и сказать до циничности просто - глистов у на меньше, чем бактерий.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]qaraabayna@lj
2009-06-18 14:18 (ссылка)
В организмах - понятно, что меньше, и наверное, в попугаяхклетках - тоже.

(Ответить) (Уровень выше)


[info]schwalbeman@lj
2009-06-19 13:56 (ссылка)
24 — вид Firmicutes, к которому относятся и полезные молочнокислые бактерии, и патогенные клостридии, и даже возбудитель столбняка

Поясните пожалуйста смысл слов. Означают ли они, что клостридии и молочнокислые бактерии - подвиды Firmicutes?

(Ответить) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-19 13:59 (ссылка)
на наименования рангов тут не стоит обращать внимания. Невежественные журналисты перепутали решительно все что могли.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]schwalbeman@lj
2009-06-20 05:30 (ссылка)
Безобразие. А я пытался понять буквально (и безуспешно).

(Ответить) (Уровень выше)


[info]ygres@lj
2009-06-21 01:58 (ссылка)
Вот хорошая книжка по теме Michael Wilson (2005) Microbial Inhabitants of Humans (http://books.google.com/books?id=q9Qx9oRKO_kC&dq=microbial+inhabitants+of+humans&printsec=frontcover&source=bn&hl=en&ei=pLo9Sp-OKKGMtgfo8L39Dw&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=4): 1500 таксонов с картинками. Меня больше поразила цифра 1 г бактерий в глазах, а не 1 кг в кишках. Кстати это была бы гораздо более полезная тема для школьников, чем дарвинизм-менделизм, да и полемика о «приобретённых признаках» решилась бы сама собой.

(Ответить) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-21 02:00 (ссылка)
э... как бы решилась полемика о благоприоьбритенных?

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]ygres@lj
2009-06-21 02:40 (ссылка)
Часть бактерий передаётся по наследству, часть приобретается из окружения. Они формируют ряд «признаков» (в книжке некоторые перечислены). Недавно был ряд работ про связь между бактериями и «признаком» толстый-худой. Вот другой пример (http://pediatrics.aappublications.org/cgi/content/full/112/1/S1/253): «a plasmid-mediated, 6-drug-resistant strain of Salmonella typhimurium was acquired by a pregnant woman after she drank raw milk. The mother was asymptomatic, but the organism was passed to her infant at birth. The infant became ill within 24 hours and subsequently developed meningitis and sepsis.» Конечно, bona fide, т.е., приобретение и передача через геном происходит гораздо реже, например с помощью вирусов, встраивающихся в геном.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)


[info]ivanov_petrov@lj
2009-06-21 03:19 (ссылка)
а, понял. Вы о том. что "фауна бактерий тела" получается в том числе и при прямом заимствовании.

Да, это давняя мысль - что экосистема живет в смысле видового состава "по Ламарку".

(Ответить) (Уровень выше)