На примере проблемы изоморфизма графов (про которую, кстати, не доказана НП-полнота).
На входе - две матрицы смежности; надо узнать, изоморфны ли графы. Задача в НП, потому что множество входов с ответом "да" - проекция множества, принадлежность к которому проверяется коротким (полиномиальным) перебором. А именно, пара матриц смежности плюс биекция между вершинами, задающая изоморфизм. Чтобы проверить, надо проверить, что это биекция, и что она сохраняет смежность-несмежность. (При проецировании просто исчезает информация о биекции).
А если графы счетны, то аналогом "легко проверяемого" множества служит борелевское: построимое за счетное число простых шагов. Проекция к "простым" шагам не относится; проекции борелевских множеств - уже более сложные, проективные. В частности, доказано, что множество пар изоморфных счетных графов - не борелевское, хотя очевидным образом есть проекция борелевского.
А вот чего я не знаю (может, просто лень разузнать) - это для какого счетного графа множество всех, ему изоморфных, - не борелевское.
Вот такие мутные размышления. Еще можно спросить
french_man@ljа, он когда-то рассказывал здесь о "теории классификации".