Я вижу два отличия (по сути дела связанных между собой):
1) Россия раздавала гражданство жителям ЮО
2) (Неформальное утверждение, но всё же): Россию вполне можно подозревать (см. пункт 1) в тайном желании присоединить ЮО и Абхазию к себе.
Вряд ли можно подумать , что американцы когда либо имели намерение сделать Косово одним из своих штатов.

1) Отличие чисто техническое. И "гражданством" я бы это называл только в кавычках. Насколько я знаю, это паспорта особого рода, кажется, даже временные. Их обладатели не могут приобретать недвижимость на территории России, например.
2) Это правда. Но, думаю, куда больше было желание вставить Саакашвили и вообще этим зарвавшимся грузинам, а заодно припугнуть этих зарвавшихся украинцев и проч. Тут аналогия полная (за исключением американской инерции по гноблению единожды назначенных "плохими парнями"). И не думаю, что сейчас Россия будет срочно признавать А и ЮО своими территориями. На фиг они не нужны ей. См. п. 1.

А откуда, собственно,
пошло желание "вставить Саакашвили и вообще этим зарвавшимся грузинам, а заодно припугнуть этих зарвавшихся украинцев и проч."?
Не от того ли, что психологически Россия на самом деле не готова признать их независимость?

От того, конечно. А США готовы психологически признать независимость Югославии? Или то, что не все хотят жить по установленным ими правилам? Как там Буш старший говорил в своей речи: "Мы будем следить за соблюдением демократии во всем мире".