Номер раз: ставить WassUp плагин и ночные билды. Номер два, проверить плагины на тормознутость. Были какие-то старые версии RSS и IRC протоколов с тормозами. Может тормозить MSN gateway, всякие nConvers могут при определённых условиях АФИГЕННО тормозить, или вылетать даже. Обязательно так же поменять PopUp на совсем новый 2.0.0.0 или выше, иначе NewEventNotify будет вылетать на больших мессагах.
Номер три плагины хистори иногда тормозят если открыты.