невежественный болван, с какого хуя ты приплел расчеты конфигурации белков?

эти твои разъяснения говна не стоят, ты ни хуя не смыслишь в предмете (а он сложный).

Но это неочевидно и потребовало выяснения. (с)

спасибо, єтой информации у меня не было

каледин, ты опять пиздишь о том, в чем не смыслишь.

https://www.facebook.com/photo.php?fbid=10222347845430939&set=a.10203372175731056&type=3

Конспировирусология

Существует конспирологическая теория происхождения нового коронавируса SARS-CoV-2. В 2015 году в журнале Nature Medicine вышла статья «A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence».

В этой работе ученые из США и Китая описывают создание искусственного гибридного коронавируса. Ученые изучали возможность заражения этим коронавирусом линии эпителиальных клеток легких человека. Оказалось, что инфицирование возможно и авторы предупредили о потенциальной угрозе передачи очередной коронавирусной инфекции от летучих мышей к людям. Ранее, по-видимому, это уже происходило в случае вируса атипичной пневмонии.

Конспирологи отметили тот факт, что китайские специалисты, которые создавали этот гибридный коронавирус, способный заражать клетки человека, работали в Институте вирусологии Уханя и позже продолжили свои исследования. Они же и открыли новое инфекционное заболевание – COVID-19. Что если новый коронавирус SARS-CoV-2 сбежал из китайской лаборатории?

Конечно, забавно, что некоторых конспирологов удивляет даже тот факт, что вирусологи, целенаправленно изучающие коронавирусы, из крупнейшего центра, изучающего коронавирусы, открыли новый коронавирус. А кто еще мог его обнаружить? Тракторист из Хогвартса?
Но главная проблема этой конспирологической теории в том, что ее очень легко проверить. В статье 2015 года указано, что авторы вносили изменения в геном адаптированного к мыши вируса SARS Coronavirus MA15, заменив в нем ген, кодирующий шиповидный белок (Spike protein) на аналогичный из другого коронавируса, который называется RsSHC014-COV. Шиповидный белок позволяет этим вирусам проникать в клетки. Новый вирус назвали SHC014-MA15.

В свободном доступе не трудно найти геномы коронавирусов MA15, RsSHC014-COV, SARS-CoV-2 и многих других коронавирусов. Эти геномы кодируют белки, аминокислотные последовательности которых можно сравнить.

За пять минут я провел такой анализ для полипротеина 1ab. Полипротеины 1ab новых коронавирусов (COVID-19) имеют между собой сходство от 99.82% до 100% (identity) – это доля совпадающих аминокислот в выравнивании. Из всех известных вирусов наиболее родственный по этому полипротеину коронавирус из летучий мыши – RaTG13 (98.53% сходства). Полипротеин ab из коронавируса MA15 имеет лишь 86.03% сходства. На картинке фрагмент выравнивания: сверху вниз расположены полипротеины 1ab из SARS-CoV-2, RaTG13 и MA15. Даже глазами видно, что третий полипротеин отличается больше остальных, т.е. эволюционно более далек.
Еще за пять минут я провел такой анализ для шиповидного белка. Как я уже писал, этот ген авторы из статьи в Nature Medicine брали из коронавируса RsSHC014 летучих мышей. Эти белки у новых коронавирусов SARS-CoV-2 имеют между собой сходство от 97.8 до 100%. Шиповидный белок из RsSHC014 имеет лишь 77.31% сходства с таковым из SARS-CoV-2. Шиповидный белок из Coronavirus MA15 имеет 75.88% сходства.

А вот наиболее родственный этому белку – его аналог из все того же коронавируса летучей мыши – RaTG13 (97.41% сходства). Этот коронавирус описан в Китае в 2013 году. Сам он людей не заражает, но у него было полно времени мутировать. Вообще про эволюцию SARS-CoV-2 недавно вышла новая статья в Nature Medicine «The proximal origin of SARS-CoV-2». Авторы также отвергают гипотезу, что вирус был искусственно сконструирован.

Таким образом, новый коронавирус SARS-CoV-2, который является виновником сложившейся пандемии, не может быть «сбежавшим» из Уханьской лаборатории гибридным вирусом, описанным в 2015 году в журнале Nature Medicine. Кейс закрыт. Это один из примеров того, для чего нужна биоинформатика.

https://www.facebook.com/photo.php?fbid=3667237946644271&set=a.188393557862078&type=3

ЛИКБЕЗ

Начнем с того, что коронавирус SARS-Cov вызывающий атипичную пневмонию был известен в 2002 г.
Потом появился MERS ближневосточный, такая же бяка из коронавирусов только с другим промежуточным хозяином (в данном случае верблюд, а в первом промежуточным была циветта).

Смертность от них была высокая: от SARS почти 10%, от MERS- 34%. Вирусологи, биологи, генетики сразу поняли, что будет жопа, когда произойдет антигенный сдвиг и дрейф, и этот SARS-Cov приобретет другие качества.
Дело в том, что предыдущие версии были не совсем удачные т.к. имели высокий % смертности: вирусу это не выгодно, он не любит убивать хозяина. Его задача наплодить себе подобных, устроить пандемию и показать человечеству кто в доме хозяин.
Вот это безмозглое существо, которое не знают к кому отнести - к живому или неживому (у него нет ничего: нет ни органов, ни органелл, ядер, ядрышек и хромосом, у него одна нитка РНК из 30К нуклеотидов, две оболочки и шипы, которыми он прицепляется к рецептору клетки-хозяина) подбирает ключик, спайк-белком открывает дверь клетки и запускает свое говняное РНК, и начинает реплицироваться как ксерокс печатает копии своего РНК. Потом строит из оболочек клетки себе капсид и суперкапсид, самоорганизовывается в так называемые вирусные частицы: это такая компашка типа футбольных фанатов, собираются в кучу и начинают все громить.

Так вот вирусу не выгодно убивать своего хозяина, поэтому когда ученые столкнулись с тем, что предыдущие короны были агрессивны, смертельны, но плохо передавались, они поняли, что следующий вариант будет легко передаваться, но иметь ниже показатель IFR [Infection Fatality Rate].
И все стали работать над тем как это может произойти, за счёт каких изменений в геноме и как скоро? Вопросов было много.
Китай понимал всю ответственность перед миром, что это может пойти от него, т.к. SARS тоже от него с резервуаром у рукокрылых.
Они даже в Ухане построили Институт вирусологии с 4 уровнем биобезопасности совместно с французами. Эта лаборатория позволяет им работать с патогенами 4 кл. опасности, а наш коронавирус 2 кл.

Все исследователи понимали как будет мутировать вирус, но как этому противостоять еще не знали. И вот он за 17 лет пройдя эволюционное давление приобрел те свойства, которые все предсказывали. Но, кстати спайк-белок S пока хреновенький, мог бы быть и лучше, и если бы его делали в лаборатории, то сделали как надо и тогда заразность была бы еще выше.
Но это вопрос времени, я думаю года 3-4 у нас есть, чтобы придумать защиту от этого хода.

Вообще эта битва как шахматная партия: вирус делает ход, а ученые всего мира думают над ответным, находят ответ. А потом вирус "думает". И эта партия продолжается столетия. Но это с учеными он столетия играет, а с природой уже миллиарды лет.
Да и еще один момент. Статьи, которые вы мне присылаете из рецензируемых журналов, имеют место быть. Они всем известны, это говорит только о том, что работы велись и очень активно, и мировая общественность информировалась.