Войти в систему

Home
    - Создать дневник
    - Написать в дневник
       - Подробный режим

LJ.Rossia.org
    - Новости сайта
    - Общие настройки
    - Sitemap
    - Оплата
    - ljr-fif

Редактировать...
    - Настройки
    - Список друзей
    - Дневник
    - Картинки
    - Пароль
    - Вид дневника

Сообщества

Настроить S2

Помощь
    - Забыли пароль?
    - FAQ
    - Тех. поддержка



Пишет ivanov_petrov ([info]ivanov_petrov)
@ 2009-12-29 21:18:00


Previous Entry  Add to memories!  Tell a Friend!  Next Entry
Кому вопросы про фрактальное устройство ДНК
http://ivanov-petrov.livejournal.com/1285579.html
Был текст про фрактальное устройство ДНК "В результате учёные сделали два основных вывода. Во-первых, человеческий геном "разбит" на два отсека: в первом хранятся активные гены, во втором более плотно изолированы "ненужные" части ДНК. Более того между двумя частями происходит постоянный обмен включающимися и выключающимися генами.
Второй вывод: геном представляет собой "фрактальную глобулу" (fractal globule). Эта структура позволяет:
упаковать ДНК невероятно компактно: плотность информации в ядре примерно в триллионы раз выше, чем в среднестатистическом компьютерном чипе;
избежать образования узлов или запутанных фрагментов, которые бы помешали нормальной работе ДНК;
быстро складываться и раскладываться геному во время активации и репрессии генов, репликации клетки."

На этот текст пришел комментарий от автора. Кто хочет спросить детали и вообще разобраться - он готов ответить
"Я прочитал комментарии, жаль что про фрактальную глобулу слышали меньше, чем хотелось. Уж, чтобы быть более точным, Гросберг был не один, а с Шахновичем и со мной (это потом было куском моей докторской). На пальцах картину мы понимали давно, а доказать более строго то, что на всех масштабах плотная незаузленная макромолекула образует мало "квазиузлов", получилось относительно недавно с помощью методов алгебраической топологии. Вообще, вся эта "складчатость" имеет тесную связь со статистикой случайных блужданий в неевклидовых постранствах. Если кому-нибудь интересно, могу пояснить...
сергей нечаев sergei.nechaev @ gmail.com"


(Читать комментарии) - (Добавить комментарий)


(Анонимно)
2009-12-30 10:47 (ссылка)
Мы показали, что топология играет принципиальную роль в формировании очень специальной микроскопической структуры. Но не надо забывать, что ДНК (и белки) - это гетерополимеры, с "замороженной" последовательностью мономеров вдоль цепи. Задача о том, как по первичной последовательности восстановить третичную структуру (для белков) - принципиальный вопрос. Теоретические работы в этом направлении велись Шахновичем и Гутиным, которые показали, что возникающая предпочтительная пространственная конфигурация полимерной цепи со случайной замороженной первичной структурой связано с нарушением репличной симметрии в модели, похожей на спиновое стекло. Этим работам лет 15, были потои м продолжения. Я не очень слежу за этим. Но могу сказать, что пока никто не брался за задачу поженит топологию и беспорядок в первичной последовательности. На вопрос о том, может ли наш подход что-то сказать о конкретных структурах в белках пока ответ отрицательный. Хотя известно, что практически все глобулярные белки незаузлены. Мы не занимались описанием конкретных биологических структур, потому что не было к этому особых оснований. Сейчас основания появились.

(Ответить)


(Читать комментарии) -