Войти в систему

Home
    - Создать дневник
    - Написать в дневник
       - Подробный режим

LJ.Rossia.org
    - Новости сайта
    - Общие настройки
    - Sitemap
    - Оплата
    - ljr-fif

Редактировать...
    - Настройки
    - Список друзей
    - Дневник
    - Картинки
    - Пароль
    - Вид дневника

Сообщества

Настроить S2

Помощь
    - Забыли пароль?
    - FAQ
    - Тех. поддержка



Пишет ivanov_petrov ([info]ivanov_petrov)
@ 2007-03-29 22:59:00


Previous Entry  Add to memories!  Tell a Friend!  Next Entry
О стратегиях обмана
http://elementy.ru/news/430251 via [info]termometr@lj
"Среди дрожжей есть штаммы «кооператоров», работающие медленно, но добросовестно: полностью окисляя питательный субстрат — глюкозу, они производят максимальное количество энергии в расчете на единицу потребленного ресурса. А есть дрожжи-«обманщики», которые очень быстро поглощают общий ресурс, но используют его неэффективно: не доводят окисление глюкозы до конца, а получив сиюминутную выгоду, выбрасывают во внешнюю среду вредные промежуточные продукты своего обмена веществ. В проточной культуре «обманщики», конкурируя с «кооператорами», полностью вытесняют их, но в несменяемой среде стратегия добросовестной работы, используемая «кооператорами», может оказаться более успешной.

Когда организмы одного вида начинают сотрудничать ради более рационального использования общего ресурса, они неизбежно сталкиваются с ограничениями, накладываемыми на каждую отдельную особь. Если речь идет о людях, то они договариваются о соблюдении определенных правил «общественного поведения». Если речь идет о микроорганизмах, то подобные правила формируются естественным отбором. В этом нет противоречия с основным принципом отбора — выживанием и размножением сильнейших. Ведь уступки, на которые идут отдельные особи, компенсируются общим благом (по крайней мере, для данной группы индивидуумов, связанных узами дальнего родства).

Но в семье не без урода. Время от времени появляются мутанты (или просто особи с другим генотипом, занесенные извне), которые не соблюдают эти правила, захватывают непропорционально много ресурсов и быстрее наращивают свою численность, а соответственно, и быстрее распространяют в популяции гены, ответственные за столь эгоистичное поведение. Однако «быстро» не означает эффективно или рационально с «точки зрения» всей популяции. Эгоистичные особи — это, как правило, еще и «обманщики» (англ. cheater). Они не несут издержек на поддержание всей популяции, работают исключительно на себя и нередко ведут к подрыву благосостояния всей популяции.

Дрожжи — микроскопические организмы, между которыми, конечно, не может быть настоящих социальных отношений. Однако конфликт интересов между представителями разных штаммов вполне возможен, тем более если эти штаммы различаются стратегиями использования ресурсов. Проблему сосуществования двух штаммов дрожжей — «кооператоров» и «обманщиков» — исследовали специалисты из Центра популяционной биологии при Лондонском имперском колледже и из Отдела математики Университета в Бате (Англия).

«Кооператоры» медленно использовали глюкозу, осуществляя в процессе дыхания полное ее окисление до СО2 и воды (при этом образовывалось большое количество АТФ на единицу потребленной глюкозы). «Обманщики» поглощали глюкозу быстрее, чем «кооператоры», но, начав процесс окисления, они не доводили его до конца, а, получив определенную выгоду (но далеко не всю, какую можно было бы получить), выбрасывали во внешнюю среду вредные промежуточные продукты своего метаболизма. Один из таких продуктов — этиловый спирт: накопление его в среде тормозит дальнейшее размножение клеток даже при наличии исходного ресурса. Выход АТФ в расчете на единицу потребленной глюкозы при столь расточительном ее использовании оказывается существенно ниже. Таким образом, платой за высокую скорость была пониженная эффективность и «загрязнение» среды вредными веществами.

В ходе экспериментов, проведенных британскими исследователями, выяснилось, что если оба штамма культивировать в хемостате (проточной культуре, где поддерживается определенная концентрация субстрата — глюкозы), то «обманщики», имея более высокую скорость популяционного роста, вытесняют «кооператоров». Однако при культивировании в колбах в среде с ограниченным количеством глюкозы оба штамма устойчиво сосуществовали, а успех «кооператоров» был выше при высокой их численности.

Модель показала хорошее соответствие результатам эксперимента. Успех «обманщиков» был наименьшим в тех случаях, когда в среде накапливалось большое количество промежуточных продуктов обмена и, соответственно, затруднялась диффузия этих веществ из клеток дрожжей. Стало понятным и то, почему в проточной культуре «обманщики» оказывались победителями. Ведь в этом случае вредные продукты обмена, выделяемые ими в среду, всё время удалялись, а скорость роста их популяций оставалась высокой, поскольку пища (глюкоза) продолжала поступать в среду.

Источник: R. Craig MacLean, Ivana Gudelj. Resource competition and social conflict in experimental populations of yeast // Nature. 2006. V. 441. P. 498-501."


Плесневый бальзам на душу. Вообще же находят и трактуют так, как думают. И мне рассуждения об обманщиках и честных производителях так понравились своей незамысловатой моралью, что я даже украл у [info]nigdeja@lj картинку




(Читать комментарии) - (Добавить комментарий)

Банальные дифференциальные уравнения
[info]termometr@lj
2007-03-29 18:50 (ссылка)
Голубев В.И. Дрожжи-киллеры: распространение и характеристика (00-04-48082). ИБФМ РАН. Пущино.

или

EMBRAPA-CNPUV Laboratorio de Microbiologia, Brasil.

The occurrence of killer toxins amongst yeast in Brazilian Riesling Italico grape must was investigated by using the sensitive strain EMBRAPA-26B as a reference strain at 18 degrees C and 28 degrees C. From a total of 85 previously isolated yeasts, 21 strains showed ability to kill the sensitive strain on unbuffered grape must/agar (MA-MB) and 0.1 M citrate/phosphate-buffered yeast extract/peptone/dextrose/agar (YEPD-MB) media both supplemented with 30 mg/l methylene blue. The killer activity of only four yeasts depended on the incubation temperature rather than the medium used. At 28 degrees C, the strains 11B and 53B were not able to show killer action. On the other hand, strains 49B and 84B did not kill the sensitive yeast at 18 degrees C. The killer strain EMBRAPA-91B and a commercial wine killer yeast K-1 were employed to examine the sensitivity of the isolated yeasts on YEPD-MB and MA-MB at 18 degrees C. The sensitivity and neutral characteristics of yeasts were shown to be dependent on the medium and the killer strain. Interactions, including K-R-, K-R+ and K+R+ strains, simultaneously, have revealed that some K-R+ strains appear to protect the K-R- strain against the killer toxin. Sensitive dead cells, although to a less extent, also exhibited similar protection. Kinetic studies have shown that the maximum specific growth rates were higher for the 20B YEPD-MB-sensitive strains (mu(max) = 0.517 h-1) than for both the 91B (mu(max) = 0.428 h-1) and K-1 (mu(max) = 0.466 h-1) killer strains. The protective capacity of neutral or sensitive cells that contaminate a fermentation, as well as the higher maximum specific growth rate of sensitive yeasts, besides other factors, may preclude the dominance of a killer strain. This protective capacity may also reduce the risk of a sensitive inoculum being killed by wild-type killer yeasts in open non-sterile fermentation.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&list_uids=8987640&dopt=Abstract

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)

Re: Банальные дифференциальные уравнения
[info]yurvor@lj
2007-03-29 18:54 (ссылка)
И? Сложность модели зависит от желаемой точности предсказания.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)

Re: Банальные дифференциальные уравнения
[info]termometr@lj
2007-03-29 19:02 (ссылка)
не могу согласится. Точность модели зависит от ее правильности (и точности параметров). А правильность скорее обратно пропорциональна ее сложности.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)

Re: Банальные дифференциальные уравнения
[info]yurvor@lj
2007-03-29 19:14 (ссылка)
Правильность модели, мне кажется, не имеет прямой со сложностью. Для простых систем лучше подходят простые модели, для сложных - сложные. Но вот если в сложных системах Вы возьмёте простую модель, то точность будет меньше. Но, возможно, приемлема - в зависимости от Ваших требований.

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)

Re: Банальные дифференциальные уравнения
[info]termometr@lj
2007-03-29 19:41 (ссылка)
Квантовые системы сложные?
А уравнение Шреденгера с гулькин нос...

(Ответить) (Уровень выше) (Ветвь дискуссии)

Re: Банальные дифференциальные уравнения
[info]yurvor@lj
2007-03-29 19:48 (ссылка)
Уравнение Шредингера сложное. И квантовые системы сложные.

(Ответить) (Уровень выше)


(Читать комментарии) -