Не одинок, ещё микоплазма, но та с нами всегда была; теперь, конечно, эволюционирует быстрее - из-за антибиотиков.
А остальные - ерунда, комменсалы; так сказать, условные патогены. Эта пара - облигатные внутриклеточные паразиты. Инфицированность стремится к 85-90% (у остальных, видимо, врождённый иммунитет); доминирующие способы передачи - давно уже вертикальный и даже бытовой.
В комплекте или поодиночке хламидии+микоплазма отвечают за рак ("помолодел"), диабет (цифры убойные), ишемическую болезнь сердца, и проч. проч., заканчивая банальным онихомикозом.

Злая микоплазма грызет наши ногти и поджелудочную... А поподробнее можно?

Не, указанные органы, как правило, грызут хламидии.
Подробнее смотрите здесь, если не боитесь (http://panacea.narod.ru/old/Chlamydiosis/chlamydiosis.htm)

Любопытно. (Нет, не боюсь, интересуюсь). Инфо по делу, только в конце реклама; но без этого, понятное дело, нельзя. Вопрос такой: там говорится про то, что хламидии поражают в основном органы со слизистой выстилкой, а потом про то, что они могут попадать и в кровоток. Интересно, гематоэнцефалический барьер они не преодолевают? Бывают ли случаи поражения мозга и психических симптомов? (Извиняюсь, если вопрос дилетантский, но мне действительно любопытно).

Психические симптомы есть всенепременнейше (прежде всего через гормональный фон, влияние на метаболизм, интоксикацию).
В мозг, видимо, попадают, в частности, похоже, что истинные мигрени вызваны микроспайками гипоталамуса. Во всяком случае, после антихламидийной и рассасывающей терапии мигрени исчезают.

Я правильно подозреваю, что достигнутый барьер инфицирования в 90% не снять, даже если прекратить прием антибиотиков (что нереально). То есть это теперь отдельно живущая проблема, с которой справляться крайне трудно?

Говорить о том, что в сложившейся ситуации виноваты исключительно или даже преимущественно антибиотики - не совсем верно. Это скорее ситуация по туберкулёзу - где антибиотиками просто-таки вырастили устойчивую к химиопрепаратам бактерию.

Что же до указанной проблемы пандемии хламидиоза, то в популяционных масштабах единственное просматривающееся решение - естественный отбор :(. Через бесплодие, раннюю инвалидизацию и даже раннюю смертность.
Но существующая медицина так просто не уйдёт, поэтому будут массовые "дети из пробирки" и поддерживающая терапия с рождения.

Н-да... Не нравится. Я, конечно, плохо понимаю... Но - если по теории - там должна быть где-то нижняя граница. В смысле, естественный отбор - он же не хаос тасует. То есть при значительном числе наследственно больных ... Там может полететь в никуда устойчивость нормы. то есть здоровых в определенном смысле вообще не останется. будет медикаментозно поддерживаемая популяция... Ладно. Может, я и ошибаюсь, и там кроме общей теории есть конкретные соображения, отчего это не так.

Может и полететь, если уже не полетела. Решение в виде естественного отбора просматривается, но не факт, что будет. Фактически в развитых странах мы уже имеем медикаментозно поддерживаемые старшие возраста, причём нижняя граница уже подбирается к 45. А в младших возрастах т.н. аутоиммунные заболевания, возможно, уже перевалили за 50%.