Все это мне очень не нравится.
> Если экосистема - конечный автомат
Если.

> Представим себе одноклеточный организм, который делится.
> Все их воспроизведения являются по сути продолжением одного организма.
> Каждое успешное воспроизведение ДНК - новая клетка, но организм по сути
> тот же (неполовое размножение).
Возможные взаимодействия между клетками не учитываются вообще? Занятно.

> Лента - это внешняя по отношению к ДНК среда с ходом времени. То есть
> ДНК воспроизводится во внешнюю среду.
Что-то мне не видно как эта лента отображает внешнюю среду. Мне вообще не ясно чему соответствую клетки автомата - клеткам организма? А расположение их - "территориальному" расположению? Или только временному? Зачем нам нужно запоминать это "временное расположение" (грубо говоря, что Н делений назад была воспроизведена клетка К)? Судя по проге - незачем, ибо они даже и не записываются. Нет у тебя ленты в проге.

> Все коэффициенты, как Ты помнишь, имеют экологическую интерпретацию
Вот ничего такого не помню.

> 1. Вероятность ошибки x - физический фактор среды, например, уровень
> радиации. Радиационные всплески препятствуют нормальной репликации ДНК.
Это в смысле нормальному делению? Угум. Но взамен мы имеем что - опять деление, только не нормальное? Это "cell=INT (RND*colors)+1" значит что при ошибке вместо следующего цвета (кстати, какое отношение эта последовательность цветов имеет к реальности, чему соответствуют цвета? мне не понятно) появляется другой? Не логичнее ли предположить что деления с большей вероятностью вообще не будет, а будет смерть клетки.

> у меня в программе 0,5 - значение коэффициента воспроизведения
Что такое этот коефициент воспроизведения и что он отображает?

> Если воспроизводится больше организмов, чем минимум выживаемости,
> то появляется пространство для генетических вариаций
А организмы знают? Откуда известно что генетические вариации возникают только если воспроизводится больше организмов, чем минимум выживаемости?

(Reply to this) (Parent) (Thread)

>> Если экосистема - конечный автомат
>Если.
Вообще-то, если теория отбора верна, то по идее, число факторов среды конечно, организма тоже, число популяции тоже... иначе непонятно, к чему приспосабливаться. Ладно, это уже дебри. Примем как исходное допущение, если Ты не считаешь, что оно в корне неверно - но о верности теории отбора спорить, наверное, нет смысла сейчас...

>Возможные взаимодействия между клетками не учитываются вообще? >Занятно.
Какие взаимодействия? Опять же, динамика популяции, конкуренция особей итд нас не интересует сейчас. Какие еще возможные взаимодействия?

>Мне вообще не ясно чему соответствую клетки автомата - клеткам >организма?
Воспроизведенным генам. Потому и запоминать их незачем.

>Не логичнее ли предположить что деления с большей вероятностью >вообще не будет, а будет смерть клетки.
Точнее, летальная мутация. Репликация происходит так же, как копирование с проверкой. Сначала копируем, потом проверяем. В реале проверяет отбор. Ошибочная клетка просто не выживет. Поэтому в модели ошибочное копирование не засчитывается как успешное, вот и все.

>> у меня в программе 0,5 - значение коэффициента воспроизведения
>Что такое этот коефициент воспроизведения и что он отображает?
Процент успешных воспроизведений. Написано ж. :)

>А организмы знают? Откуда известно что генетические вариации >возникают только если воспроизводится больше организмов, чем >минимум выживаемости?
Отбор. Если воспроизводимость 0.4, а выживаемость 0.5, то ни одна особь не выживет в среде. Какие уж тут вариации. Если существует зазор между воспроизводимостью и выживаемостью, то среда оставляет "простор для маневрирования". Генетические вариации есть всегда, но выживают они только, если есть резерв приспособляемости. Биоразнообразие этим и объясняется. Если бы однородная среда жестко задавала условия выживания, то был бы один-единственный вид, наиболее приспособленный.

(Reply to this) (Parent) (Thread)

> динамика популяции, конкуренция особей итд нас не интересует сейчас
Динамика как статистическое отображение числа клеток не интересует сама по себе. А вот как фактор, влияющий на "воспроизведение генов"? Не должна ли учитыватся в алгоритме?

> Генетические вариации есть всегда
Так значит есть всегда. А воспроизведимость и выживаемость ведь не константы.

>>> у меня в программе 0,5 - значение коэффициента воспроизведения
>> Что такое этот коефициент воспроизведения и что он отображает?
> Процент успешных воспроизведений. Написано ж. :)
Так он задан наперед? А зачем "вероятность ошибки"?

(Reply to this) (Parent) (Thread)

>Динамика как статистическое отображение числа клеток не >интересует сама по себе. А вот как фактор, влияющий >на "воспроизведение генов"? Не должна ли учитыватся в >алгоритме?
Не влияет динамика популяции на репликацию ДНК.

>А воспроизведимость и выживаемость ведь не константы.
Воспроизводимость не константа, она меняется обратно сложности программы. Голубая линия на графиках. Пересмотри еще раз программу или описание модели.
Выживаемость - фактор среды - константа, потому что мы рассматриваем стабильную среду.

>>>> у меня в программе 0,5 - значение коэффициента воспроизведения
>>> Что такое этот коефициент воспроизведения и что он отображает?
>> Процент успешных воспроизведений. Написано ж. :)
>Так он задан наперед? А зачем "вероятность ошибки"?
Кто задан наперед? Там было написано:
"Порог эволюции" - у меня в программе 0,5 - значение коэффициента воспроизведения, при котором возможно усложение программы. По сути, это выживаемость потомства.
Коэффициент воспроизведения рассчитывается, его пороговое значение экзогенно. Читай или программу, или описание, но внимательнее, ради бога...

(Reply to this) (Parent) (Thread)

> Не влияет динамика популяции на репликацию ДНК.
А на вероятность успеха репликации влияет?

(Reply to this) (Parent) (Thread)

Нет, потому что среда клетки и среда экосистемы - разные вещи.

(Reply to this) (Parent)