Презумпция невиновности создана для защиты граждан от произвола государства. Она не должна распространяться на само государство. Собственно, сама терминология здесь дурная: по-хорошему, исключительно государство должно вершить правосудие. Когда возникают сомнения в том, что оно не нарушает это правило, «презумпция невиновности» превращается в бессмысленное понятие.

Другое дело, что презумпция виновности (в отношении кого бы то ни было) — это фашизм какой-то.

Государство -- это институт абстрактные понятие, а конкретные чиновники, в том числе и сам президент -- это тоже граждане государства, на которых, хотя и с некоторыми оговорками, тоже распространяются общеюридические нормы.

Хотя, по-моему, имеет смысл вести речь скорее про некий высший суд, перед которым все равны.

Презумпция вины действует в гражданских делах, её противоположность - презумпция невиновности действует в уголовных делах. Вот такой вот фошизм.