мне не понятна сама идея их противопоставления
В науке можно опыты ставить, чтобы что-то проверять, в теологии — нет.

наглядно и объективно выявить превосходство одной идеологии над другой
Возможность мало работать и не помирать с голоду вроде бы на науке основана.
Если бы появлялись новые религии, где вместо запретов есть свинину или праздников опресноков были бы другие священные указания (как атомные реакторы кошерно строить, например), можно было бы поспорить, но в нашем мире всё-таки благополучие основано на достижениях науки.